A snapshot love story: what serial crystallography has done and will do for us

References

First citationAlpert, B., Banerjee, R. & Lindqvist, L. (1974). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 71, 558–562.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationAustin, R. H., Beeson, K. W., Eisenstein, L., Frauenfelder, H. & Gunsalus, I. C. (1975). Biochemistry, 14, 5355–5373.  CrossRef PubMed CAS Web of Science Google Scholar
First citationBarends, T. R., Foucar, L., Ardevol, A., Nass, K., Aquila, A., Botha, S., Doak, R. B., Falahati, K., Hartmann, E., Hilpert, M., Heinz, M., Hoffmann, M. C., Köfinger, J., Koglin, J. E., Kovacsova, G., Liang, M., Milathianaki, D., Lemke, H. T., Reinstein, J., Roome, C. M., Shoeman, R. L., Williams, G. J., Burghardt, I., Hummer, G., Boutet, S. & Schlichting, I. (2015). Science, 350, 445–450.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationBarends, T. R. M., Gorel, A., Bhattacharyya, S., Schirò, G., Bacellar, C., Cirelli, C., Colletier, J.-P., Foucar, L., Grünbein, M. L., Hartmann, E., Hilpert, M., Holton, J. M., Johnson, P. J. M., Kloos, M., Knopp, G., Marekha, B., Nass, K., Nass Kovacs, G., Ozerov, D., Stricker, M., Weik, M., Doak, R. B., Shoeman, R. L., Milne, C. J., Huix-Rotllant, M., Cammarata, M. & Schlichting, I. (2024). Nature, 626, 905–911.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationBarends, T. R. M., Stauch, B., Cherezov, V. & Schlichting, I. (2022). Nat. Rev. Methods Primers, 2, 59.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationBarty, A., Caleman, C., Aquila, A., Timneanu, N., Lomb, L., White, T. A., Andreasson, J., Arnlund, D., Bajt, S., Barends, T. R. M., Barthelmess, M., Bogan, M. J., Bostedt, C., Bozek, J. D., Coffee, R., Coppola, N., Davidsson, J., DePonte, D. P., Doak, R. B., Ekeberg, T., Elser, V., Epp, S. W., Erk, B., Fleckenstein, H., Foucar, L., Fromme, P., Graafsma, H., Gumprecht, L., Hajdu, J., Hampton, C. Y., Hartmann, R., Hartmann, A., Hauser, G., Hirsemann, H., Holl, P., Hunter, M. S., Johansson, L., Kassemeyer, S., Kimmel, N., Kirian, R. A., Liang, M., Maia, F. R. N. C., Malmerberg, E., Marchesini, S., Martin, A. V., Nass, K., Neutze, R., Reich, C., Rolles, D., Rudek, B., Rudenko, A., Scott, H., Schlichting, I., Schulz, J., Seibert, M. M., Shoeman, R. L., Sierra, R. G., Soltau, H., Spence, J. C. H., Stellato, F., Stern, S., Strüder, L., Ullrich, J., Wang, X., Weidenspointner, G., Weierstall, U., Wunderer, C. B. & Chapman, H. N. (2012). Nat. Photonics, 6, 35–40.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationBeale, J. H., Bolton, R., Marshall, S. A., Beale, E. V., Carr, S. B., Ebrahim, A., Moreno-Chicano, T., Hough, M. A., Worrall, J. A. R., Tews, I. & Owen, R. L. (2019). J. Appl. Cryst. 52, 1385–1396.  Web of Science CrossRef CAS IUCr Journals Google Scholar
First citationBerman, H., Henrick, K. & Nakamura, H. (2003). Nat. Struct. Mol. Biol. 10, 980.  Web of Science CrossRef Google Scholar
First citationBetzel, C., Prester, A., Perbandt, M., Galchenkova, M., Oberthuer, D., Werner, N., Henkel, A., Maracke, J., Yefanov, O., Hakanpää, J., Pompidor, G., Meyer, J., Chapman, H., Aepfelbacher, M., Hinrichs, W. & Rohde, H. (2023). Research Square, https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-3173899/v1Google Scholar
First citationBeyerlein, K. R., Dierksmeyer, D., Mariani, V., Kuhn, M., Sarrou, I., Ottaviano, A., Awel, S., Knoska, J., Fuglerud, S., Jönsson, O., Stern, S., Wiedorn, M. O., Yefanov, O., Adriano, L., Bean, R., Burkhardt, A., Fischer, P., Heymann, M., Horke, D. A., Jungnickel, K. E. J., Kovaleva, E., Lorbeer, O., Metz, M., Meyer, J., Morgan, A., Pande, K., Panneerselvam, S., Seuring, C., Tolstikova, A., Lieske, J., Aplin, S., Roessle, M., White, T. A., Chapman, H. N., Meents, A. & Oberthuer, D. (2017). IUCrJ, 4, 769–777.  Web of Science CrossRef CAS PubMed IUCr Journals Google Scholar
First citationBhowmick, A., Hussein, R., Bogacz, I., Simon, P. S., Ibrahim, M., Chatterjee, R., Doyle, M. D., Cheah, M. H., Fransson, T., Chernev, P., Kim, I.-S., Makita, H., Dasgupta, M., Kaminsky, C. J., Zhang, M., Gätcke, J., Haupt, S., Nangca, I. I., Keable, S. M., Aydin, A. O., Tono, K., Owada, S., Gee, L. B., Fuller, F. D., Batyuk, A., Alonso-Mori, R., Holton, J. M., Paley, D. W., Moriarty, N. W., Mamedov, F., Adams, P. D., Brewster, A. S., Dobbek, H., Sauter, N. K., Bergmann, U., Zouni, A., Messinger, J., Kern, J., Yano, J. & Yachandra, V. K. (2023). Nature, 617, 629–636.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationBosman, R., Prester, A., Sung, S., von Soosten, L., Dibenedetto, S., Bartels, K., von Stetten, D., Mehrabi, P., Blatter, M., Lu, G., Suer, B., Wilmanns, M., Osbild, M. & Schulz, E. C. (2024). Cell. Rep. Phys. Sci. 5, 101987.  CrossRef Google Scholar
First citationBrändén, G. & Neutze, R. (2021). Science, 373, eaba0954.  Web of Science PubMed Google Scholar
First citationBrewster, A. S., Waterman, D. G., Parkhurst, J. M., Gildea, R. J., Young, I. D., O'Riordan, L. J., Yano, J., Winter, G., Evans, G. & Sauter, N. K. (2018). Acta Cryst. D74, 877–894.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
First citationBrookner, D. E. & Hekstra, D. R. (2024). J. Appl. Cryst. 57, 885–895.  CrossRef CAS IUCr Journals Google Scholar
First citationButryn, A., Simon, P. S., Aller, P., Hinchliffe, P., Massad, R. N., Leen, G., Tooke, C. L., Bogacz, I., Kim, I.-S., Bhowmick, A., Brewster, A. S., Devenish, N. E., Brem, J., Kamps, J. J. A. G., Lang, P. A., Rabe, P., Axford, D., Beale, J. H., Davy, B., Ebrahim, A., Orlans, J., Storm, S. L. S., Zhou, T., Owada, S., Tanaka, R., Tono, K., Evans, G., Owen, R. L., Houle, F. A., Sauter, N. K., Schofield, C. J., Spencer, J., Yachandra, V. K., Yano, J., Kern, J. F. & Orville, A. M. (2021). Nat. Commun. 12, 4461.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationCalvey, G. D., Katz, A. M. & Pollack, L. (2019). Anal. Chem. 91, 7139–7144.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationCalvey, G. D., Katz, A. M., Schaffer, C. B. & Pollack, L. (2016). Struct. Dyn. 3, 054301.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationCaramello, N. & Royant, A. (2024). Acta Cryst. D80, 60–79.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
First citationCarrillo, M., Mason, T., Karpik, A., Martiel, I., Kepa, M., McAuley, K., Beale, J. & Padeste, C. (2023). IUCrJ, 10, 678–693.  Web of Science CrossRef CAS PubMed IUCr Journals Google Scholar
First citationCellini, A., Shankar, M. K., Nimmrich, A., Hunt, L. A., Monrroy, L., Mutisya, J., Furrer, A., Beale, E. V., Carrillo, M., Malla, T. N., Maj, P., Vrhovac, L., Dworkowski, F., Cirelli, C., Johnson, P. J. M., Ozerov, D., Stojković, E. A., Hammarström, L., Bacellar, C., Standfuss, J., Maj, M., Schmidt, M., Weinert, T., Ihalainen, J. A., Wahlgren, W. Y. & Westenhoff, S. (2024). Nat. Chem. 16, 624–632.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationChapman, H. N., Barty, A., Bogan, M. J., Boutet, S., Frank, M., Hau-Riege, S. P., Marchesini, S., Woods, B. W., Bajt, S., Benner, W. H., London, R. A., Plönjes, E., Kuhlmann, M., Treusch, R., Düsterer, S., Tschentscher, T., Schneider, J. R., Spiller, E., Möller, T., Bostedt, C., Hoener, M., Shapiro, D. A., Hodgson, K. O., van der Spoel, D., Burmeister, F., Bergh, M., Caleman, C., Huldt, G., Seibert, M. M., Maia, F. R. N. C., Lee, R. W., Szöke, A., Timneanu, N. & Hajdu, J. (2006). Nat. Phys. 2, 839–843.  Web of Science CrossRef CAS Google Scholar
First citationChapman, H. N., Caleman, C. & Timneanu, N. (2014). Philos. Trans. R. Soc. B, 369, 20130313.  Web of Science CrossRef Google Scholar
First citationChapman, H. N., Fromme, P., Barty, A., White, T. A., Kirian, R. A., Aquila, A., Hunter, M. S., Schulz, J., DePonte, D. P., Weierstall, U., Doak, R. B., Maia, F. R. N. C., Martin, A. V., Schlichting, I., Lomb, L., Coppola, N., Shoeman, R. L., Epp, S. W., Hartmann, R., Rolles, D., Rudenko, A., Foucar, L., Kimmel, N., Weidenspointner, G., Holl, P., Liang, M., Barthelmess, M., Caleman, C., Boutet, S., Bogan, M. J., Krzywinski, J., Bostedt, C., Bajt, S., Gumprecht, L., Rudek, B., Erk, B., Schmidt, C., Hömke, A., Reich, C., Pietschner, D., Strüder, L., Hauser, G., Gorke, H., Ullrich, J., Herrmann, S., Schaller, G., Schopper, F., Soltau, H., Kühnel, K.-U., Messerschmidt, M., Bozek, J. D., Hau-Riege, S. P., Frank, M., Hampton, C. Y., Sierra, R. G., Starodub, D., Williams, G. J., Hajdu, J., Timneanu, N., Seibert, M. M., Andreasson, J., Rocker, A., Jönsson, O., Svenda, M., Stern, S., Nass, K., Andritschke, R., Schröter, C.-D., Krasniqi, F., Bott, M., Schmidt, K. E., Wang, X., Grotjohann, I., Holton, J. M., Barends, T. R. M., Neutze, R., Marchesini, S., Fromme, R., Schorb, S., Rupp, D., Adolph, M., Gorkhover, T., Andersson, I., Hirsemann, H., Potdevin, G., Graafsma, H., Nilsson, B. & Spence, J. C. H. (2011). Nature, 470, 73–77.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationChretien, A., Nagel, M. F., Botha, S., de Wijn, R., Brings, L., Dörner, K., Han, H., Koliyadu, J. C. P., Letrun, R., Round, A., Sato, T., Schmidt, C., Secareanu, R.-C., von Stetten, D., Vakili, M., Wrona, A., Bean, R., Mancuso, A., Schulz, J., Pearson, A. R., Kottke, T., Lorenzen, K. & Schubert, R. (2024). J. Mol. Biol. 436, 168439.  CrossRef PubMed Google Scholar
First citationChristou, N.-E., Apostolopoulou, V., Melo, D. V. M., Ruppert, M., Fadini, A., Henkel, A., Sprenger, J., Oberthuer, D., Günther, S., Pateras, A., Rahmani Mashhour, A., Yefanov, O. M., Galchenkova, M., Reinke, P. Y. A., Kremling, V., Scheer, T. E. S., Lange, E. R., Middendorf, P., Schubert, R., De Zitter, E., Lumbao-Conradson, K., Herrmann, J., Rahighi, S., Kunavar, A., Beale, E. V., Beale, J. H., Cirelli, C., Johnson, P. J. M., Dworkowski, F., Ozerov, D., Bertrand, Q., Wranik, M., Bacellar, C., Bajt, S., Wakatsuki, S., Sellberg, J. A., Huse, N., Turk, D., Chapman, H. N. & Lane, T. J. (2023). Science, 382, 1015–1020.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationColletier, J.-P., Sawaya, M. R., Gingery, M., Rodriguez, J. A., Cascio, D., Brewster, A. S., Michels-Clark, T., Hice, R. H., Coquelle, N., Boutet, S., Williams, G. J., Messerschmidt, M., DePonte, D. P., Sierra, R. G., Laksmono, H., Koglin, J. E., Hunter, M. S., Park, H. W., Uervirojnangkoorn, M., Bideshi, D. K., Brunger, A. T., Federici, B. A., Sauter, N. K. & Eisenberg, D. S. (2016). Nature, 539, 43–47.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationCoquelle, N., Sliwa, M., Woodhouse, J., Schirò, G., Adam, V., Aquila, A., Barends, T. R. M., Boutet, S., Byrdin, M., Carbajo, S., De la Mora, E., Doak, R. B., Feliks, M., Fieschi, F., Foucar, L., Guillon, V., Hilpert, M., Hunter, M. S., Jakobs, S., Koglin, J. E., Kovacsova, G., Lane, T. J., Lévy, B., Liang, M., Nass, K., Ridard, J., Robinson, J. S., Roome, C. M., Ruckebusch, C., Seaberg, M., Thepaut, M., Cammarata, M., Demachy, I., Field, M., Shoeman, R. L., Bourgeois, D., Colletier, J.-P., Schlichting, I. & Weik, M. (2018). Nat. Chem. 10, 31–37.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationCornish-Bowden, A. (1979). Fundamentals of Enzyme Kinetics, pp. 16–38. London: Butterworth-Heinemann.  Google Scholar
First citationDalton, K. M., Greisman, J. B. & Hekstra, D. R. (2022). Nat. Commun. 13, 7764.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationDasgupta, M., Budday, D., de Oliveira, S. H. P., Madzelan, P., Marchany-Rivera, D., Seravalli, J., Hayes, B., Sierra, R. G., Boutet, S., Hunter, M. S., Alonso-Mori, R., Batyuk, A., Wierman, J., Lyubimov, A., Brewster, A. S., Sauter, N. K., Applegate, G. A., Tiwari, V. K., Berkowitz, D. B., Thompson, M. C., Cohen, A. E., Fraser, J. S., Wall, M. E., van den Bedem, H. & Wilson, M. A. (2019). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 116, 25634–25640.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationDESY (2024). P09 HiPhaX. https://photon-science.desy.de/facilities/petra_iii/beamlines/p09_resonant_diffraction___hiphax/p09_hiphax/FlashFigure3NEU_thumbnail_eng.htmlGoogle Scholar
First citationDe Zitter, E., Coquelle, N., Oeser, P., Barends, T. R. M. & Colletier, J.-P. (2022). Commun. Biol. 5, 640.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationDo, T. N., Menendez, D., Bizhga, D., Stojković, E. A. & Kennis, J. T. M. (2024). J. Mol. Biol. 436, 168357.  CrossRef PubMed Google Scholar
First citationDoak, R. B., Nass Kovacs, G., Gorel, A., Foucar, L., Barends, T. R. M., Grünbein, M. L., Hilpert, M., Kloos, M., Roome, C. M., Shoeman, R. L., Stricker, M., Tono, K., You, D., Ueda, K., Sherrell, D. A., Owen, R. L. & Schlichting, I. (2018). Acta Cryst. D74, 1000–1007.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
First citationDunge, A., Phan, C., Uwangue, O., Bjelcic, M., Gunnarsson, J., Wehlander, G., Käck, H. & Brändén, G. (2023). bioRxiv, 2023.12.21.572778.  Google Scholar
First citationDuszenko, M., Redecke, L., Mudogo, C. N., Sommer, B. P., Mogk, S., Oberthuer, D. & Betzel, C. (2015). Acta Cryst. F71, 929–937.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
First citationEbrahim, A., Riley, B. T., Kumaran, D., Andi, B., Fuchs, M. R., McSweeney, S. & Keedy, D. A. (2022). IUCrJ, 9, 682–694.  Web of Science CrossRef CAS PubMed IUCr Journals Google Scholar
First citationEmma, P., Akre, R., Arthur, J., Bionta, R., Bostedt, C., Bozek, J., Brachmann, A., Bucksbaum, P., Coffee, R., Decker, F. J., Ding, Y., Dowell, D., Edstrom, S., Fisher, A., Frisch, J., Gilevich, S., Hastings, J., Hays, G., Hering, P., Huang, Z., Iverson, R., Loos, H., Messerschmidt, M., Miahnahri, A., Moeller, S., Nuhn, H. D., Pile, G., Ratner, D., Rzepiela, J., Schultz, D., Smith, T., Stefan, P., Tompkins, H., Turner, J., Welch, J., White, W., Wu, J., Yocky, G. & Galayda, J. (2010). Nat. Photon. 4, 641–647.  Web of Science CrossRef CAS Google Scholar
First citationFadini, A., Hutchison, C. D. M., Morozov, D., Chang, J., Maghlaoui, K., Perrett, S., Luo, F., Kho, J. C. X., Romei, M. G., Morgan, R. M. L., Orr, C. M., Cordon-Preciado, V., Fujiwara, T., Nuemket, N., Tosha, T., Tanaka, R., Owada, S., Tono, K., Iwata, S., Boxer, S. G., Groenhof, G., Nango, E. & van Thor, J. J. (2023). J. Am. Chem. Soc. 145, 15796–15808.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationFraser, J. S., van den Bedem, H., Samelson, A. J., Lang, P. T., Holton, J. M., Echols, N. & Alber, T. (2011). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 108, 16247–16252.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
First citationGarcía-Nafría, J. & Tate, C. G. (2021). Biochem. Soc. Trans. 49, 2345–2355.  Web of Science PubMed Google Scholar
First citationGarman, E. F. & Schneider, T. R. (1997). J. Appl. Cryst. 30, 211–237.  CrossRef Web of Science IUCr Journals Google Scholar
First citationGarman, E. F. & Weik, M. (2023). Curr. Opin. Struct. Biol. 82, 102662.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
First citationGati, C., Oberthuer, D., Yefanov, O., Bunker, R. D., Stellato, F., Chiu, E., Yeh, S. M., Aquila, A., Basu, S., Bean, R., Beyerlein, K. R., Botha, S., Boutet, S., DePonte, D. P., Doak, R. B., Fromme, R., Galli, L., Grotjohann, I., James, D. R., Kupitz, C., Lomb, L., Messerschmidt, M., Nass, K., Rendek, K., Shoeman, R. L., Wang, D., Weierstall, U., White, T. A., Williams, G. J., Zatsepin, N. A., Fromme, P., Spence, J. C. H., Goldie, K. N., Jehle, J. A., Metcalf, P., Barty, A. & Chapman, H. N. (2017). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 114, 2247–2252.  Web of Science CrossRef

留言 (0)

沒有登入
gif