Afonine, P. V., Poon, B. K., Read, R. J., Sobolev, O. V., Terwilliger, T. C., Urzhumtsev, A. & Adams, P. D. (2018). Acta Cryst. D74, 531–544.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Agirre, J., Atanasova, M., Bagdonas, H., Ballard, C. B., Baslé, A., Beilsten-Edmands, J., Borges, R. J., Brown, D. G., Burgos-Mármol, J. J., Berrisford, J. M., Bond, P. S., Caballero, I., Catapano, L., Chojnowski, G., Cook, A. G., Cowtan, K. D., Croll, T. I., Debreczeni, J. É., Devenish, N. E., Dodson, E. J., Drevon, T. R., Emsley, P., Evans, G., Evans, P. R., Fando, M., Foadi, J., Fuentes-Montero, L., Garman, E. F., Gerstel, M., Gildea, R. J., Hatti, K., Hekkelman, M. L., Heuser, P., Hoh, S. W., Hough, M. A., Jenkins, H. T., Jiménez, E., Joosten, R. P., Keegan, R. M., Keep, N., Krissinel, E. B., Kolenko, P., Kovalevskiy, O., Lamzin, V. S., Lawson, D. M., Lebedev, A. A., Leslie, A. G. W., Lohkamp, B., Long, F., Malý, M., McCoy, A. J., McNicholas, S. J., Medina, A., Millán, C., Murray, J. W., Murshudov, G. N., Nicholls, R. A., Noble, M. E. M., Oeffner, R., Pannu, N. S., Parkhurst, J. M., Pearce, N., Pereira, J., Perrakis, A., Powell, H. R., Read, R. J., Rigden, D. J., Rochira, W., Sammito, M., Sánchez Rodríguez, F., Sheldrick, G. M., Shelley, K. L., Simkovic, F., Simpkin, A. J., Skubak, P., Sobolev, E., Steiner, R. A., Stevenson, K., Tews, I., Thomas, J. M. H., Thorn, A., Valls, J. T., Uski, V., Usón, I., Vagin, A., Velankar, S., Vollmar, M., Walden, H., Waterman, D., Wilson, K. S., Winn, M. D., Winter, G., Wojdyr, M. & Yamashita, K. (2023). Acta Cryst. D79, 449–461.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Asokan, G. V., Ramadhan, T., Ahmed, E. & Sanad, H. (2019). Oman Med. J. 34, 184–193.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Bai, Y., Yang, J., Zhou, X., Ding, X., Eisele, L. E. & Bai, G. (2012). PLoS One, 7, e35206.  CrossRef PubMed Google Scholar
Blötz, C., Treffon, K., Kaever, V., Schwede, F., Hammer, E. & Stülke, J. (2017). Front. Microbiol. 8, 1328.  PubMed Google Scholar
Boby, M. L., Fearon, D., Ferla, M., Filep, M., Koekemoer, L., Robinson, M. C., Chodera, J. D., Lee, A. A., London, N., von Delft, A., von Delft, F., Achdout, H., Aimon, A., Alonzi, D. S., Arbon, R., Aschenbrenner, J. C., Balcomb, B. H., Bar-David, E., Barr, H. & Zvornicanin, S. N. (2023). Science, 382, eabo7201.  CrossRef PubMed Google Scholar
Cassini, A., Högberg, L. D., Plachouras, D., Quattrocchi, A., Hoxha, A., Simonsen, G. S., Colomb-Cotinat, M., Kretzschmar, M. E., Devleesschauwer, B., Cecchini, M., Ouakrim, D. A., Oliveira, T. C., Struelens, M. J., Suetens, C., Monnet, D. L., Strauss, R., Mertens, K., Struyf, T., Catry, B., Latour, K., Ivanov, I. N., Dobreva, E. G., Tambic Andraševic, A., Soprek, S., Budimir, A., Paphitou, N., Žemlicková, H., Schytte Olsen, S., Wolff Sönksen, U., Märtin, P., Ivanova, M., Lyytikäinen, O., Jalava, J., Coignard, B., Eckmanns, T., Abu Sin, M., Haller, S., Daikos, G. L., Gikas, A., Tsiodras, S., Kontopidou, F., Tóth, Á., Hajdu, Á., Guðlaugsson, Ó., Kristinsson, K. G., Murchan, S., Burns, K., Pezzotti, P., Gagliotti, C., Dumpis, U., Liuimiene, A., Perrin, M., Borg, M. A., de Greeff, S. C., Monen, J. C., Koek, M. B., Elstrøm, P., Zabicka, D., Deptula, A., Hryniewicz, W., Caniça, M., Nogueira, P. J., Fernandes, P. A., Manageiro, V., Popescu, G. A., Serban, R. I., Schréterová, E., Litvová, S., Štefkovicová, M., Kolman, J., Klavs, I., Korošec, A., Aracil, B., Asensio, A., Pérez-Vázquez, M., Billström, H., Larsson, S., Reilly, J. S., Johnson, A. & Hopkins, S. (2019). Lancet Infect. Dis. 19, 56–66.  CrossRef PubMed Google Scholar
Commichau, F. M., Heidemann, J. L., Ficner, R. & Stülke, J. (2019). J. Bacteriol. 201, 1–14.  CrossRef Google Scholar
Corrigan, R. M., Abbott, J. C., Burhenne, H., Kaever, V. & Gründling, A. (2011). PLoS Pathog. 7, e1002217.  Web of Science CrossRef PubMed Google Scholar
Corrigan, R. M. & Gründling, A. (2013). Nat. Rev. Microbiol. 11, 513–524.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Diederichs, K. & Karplus, P. A. (1997). Nat. Struct. Mol. Biol. 4, 269–275.  CrossRef CAS Web of Science Google Scholar
Eberhardt, J., Santos-Martins, D., Tillack, A. F. & Forli, S. (2021). J. Chem. Inf. Model. 61, 3891–3898.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Emsley, P., Lohkamp, B., Scott, W. G. & Cowtan, K. (2010). Acta Cryst. D66, 486–501.  Web of Science CrossRef CAS IUCr Journals Google Scholar
Erlanson, D. A., Fesik, S. W., Hubbard, R. E., Jahnke, W. & Jhoti, H. (2016). Nat. Rev. Drug Discov. 15, 605–619.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Giordanetto, F., Jin, C., Willmore, L., Feher, M. & Shaw, D. E. (2019). J. Med. Chem. 62, 3381–3394.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Gundlach, J., Rath, H., Herzberg, C., Mäder, U. & Stülke, J. (2016). Front. Microbiol. 7, https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00804.  CrossRef Google Scholar
Heidemann, J. L., Neumann, P., Dickmanns, A. & Ficner, R. (2019). J. Biol. Chem. 294, 10463–10470.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Huschmann, F. U., Linnik, J., Sparta, K., Ühlein, M., Wang, X., Metz, A., Schiebel, J., Heine, A., Klebe, G., Weiss, M. S. & Mueller, U. (2016). Acta Cryst. F72, 346–355.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Jackson-Litteken, C. D., Ratliff, C. T., Kneubehl, A. R., Siletti, C., Pack, L., Lan, R., Huynh, T. N., Lopez, J. E. & Blevins, J. S. (2021). Infect. Immun. 89, e00787-20.  CAS PubMed Google Scholar
Kabsch, W. (2010). Acta Cryst. D66, 125–132.  Web of Science CrossRef CAS IUCr Journals Google Scholar
Kick, E. K., Roe, D. C., Skillman, A. G., Liu, G., Ewing, T. J. A., Sun, Y., Kuntz, I. D. & Ellman, J. A. (1997). Chem. Biol. 4, 297–307.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Liebeschuetz, J. W., Jones, S. D., Morgan, P. J., Murray, C. W., Rimmer, A. D., Roscoe, J. M. E., Waszkowycz, B., Welsh, P. M., Wylie, W. A., Young, S. C., Martin, H., Mahler, J., Brady, L. & Wilkinson, K. (2002). J. Med. Chem. 45, 1221–1232.  CrossRef PubMed CAS Google Scholar
Liebschner, D., Afonine, P. V., Baker, M. L., Bunkóczi, G., Chen, V. B., Croll, T. I., Hintze, B., Hung, L.-W., Jain, S., McCoy, A. J., Moriarty, N. W., Oeffner, R. D., Poon, B. K., Prisant, M. G., Read, R. J., Richardson, J. S., Richardson, D. C., Sammito, M. D., Sobolev, O. V., Stockwell, D. H., Terwilliger, T. C., Urzhumtsev, A. G., Videau, L. L., Williams, C. J. & Adams, P. D. (2019). Acta Cryst. D75, 861–877.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Liebschner, D., Afonine, P. V., Moriarty, N. W., Poon, B. K., Sobolev, O. V., Terwilliger, T. C. & Adams, P. D. (2017). Acta Cryst. D73, 148–157.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
McNutt, A. T., Francoeur, P., Aggarwal, R., Masuda, T., Meli, R., Ragoza, M., Sunseri, J. & Koes, D. R. (2021). J. Cheminform, 13, 43.  CrossRef PubMed Google Scholar
Mehne, F. M. P., Gunka, K., Eilers, H., Herzberg, C., Kaever, V. & Stülke, J. (2013). J. Biol. Chem. 288, 2004–2017.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Murshudov, G. N., Skubák, P., Lebedev, A. A., Pannu, N. S., Steiner, R. A., Nicholls, R. A., Winn, M. D., Long, F. & Vagin, A. A. (2011). Acta Cryst. D67, 355–367.  Web of Science CrossRef CAS IUCr Journals Google Scholar
Neumann, P., Kloskowski, P. & Ficner, R. (2023). microLife, 4, uqad021.  CrossRef PubMed Google Scholar
Neumann, P. & Tittmann, K. (2014). Curr. Opin. Struct. Biol. 29, 122–133.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Pearce, N. M., Krojer, T. & von Delft, F. (2017). Acta Cryst. D73, 256–266.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Römling, U. (2008). Sci. Signal. 1, pe39.  Web of Science PubMed Google Scholar
Rørvik, G. H., Liskiewicz, K. A., Kryuchkov, F., Naemi, A., Aasheim, H., Petersen, F. C., Küntziger, T. M. & Simm, R. (2020). Microorganisms, 8, 1269.  PubMed Google Scholar
Rosenberg, J., Dickmanns, A., Neumann, P., Gunka, K., Arens, J., Kaever, V., Stülke, J., Ficner, R. & Commichau, F. M. (2015). J. Biol. Chem. 290, 6596–6606.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Sanner, M. (1999). J. Mol. Graph. Model. 17, 57–61.  Web of Science PubMed CAS Google Scholar
Schuster, C. F., Bellows, L. E., Tosi, T., Campeotto, I., Corrigan, R. M., Freemont, P. & Gründling, A. (2016). Sci. Signal. 9, ra81.  CrossRef PubMed Google Scholar
Trott, O. & Olson, A. J. (2010). J. Comput. Chem. 31, 455–461.  Web of Science CrossRef PubMed CAS Google Scholar
Whiteley, A. T., Garelis, N. E., Peterson, B. N., Choi, P. H., Tong, L., Woodward, J. J. & Portnoy, D. A. (2017). Mol. Microbiol. 104, 212–233.  CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Witte, G., Hartung, S., Büttner, K. & Hopfner, K. (2008). Mol. Cell, 30, 167–178.  CrossRef PubMed CAS Google Scholar
Wojdyr, M., Keegan, R., Winter, G. & Ashton, A. (2013). Acta Cryst. A69, s299.  Web of Science CrossRef IUCr Journals Google Scholar
Wollenhaupt, J., Barthel, T., Lima, G. M. A., Metz, A., Wallacher, D., Jagudin, E., Huschmann, F. U., Hauss, T., Feiler, C. G., Gerlach, M., Hellmig, M., Förster, R., Steffien, M., Heine, A., Klebe, G., Mueller, U. & Weiss, M. S. (2021). J. Vis. Exp., e62208.  Google Scholar
Woodward, J. J., Iavarone, A. T. & Portnoy, D. A. (2010). Science, 328, 1703–1705.  Web of Science CrossRef CAS PubMed Google Scholar
Zarrella, T. M., Yang, J., Metzger, D. W. & Bai, G. (2020). J. Bacteriol. 202, https://doi.org/10.1128/jb.00691-19.  CrossRef Google Scholar