Feed occupies a significant proportion in the production cost of pigs, and the feed efficiency (FE) in pigs is of utmost economic importance. Hence, the objective of this study is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and candidate genes associated with FE-related traits, including feed conversion ratio (FCR) and residual feed intake (RFI). A genome-wide association study was conducted for FCR and RFI in 169 Yorkshire pigs using whole-genome sequencing data. A total of 23 and 33 suggestive significant SNPs (P < 1 × 10−6) were detected for FCR and RFI, respectively. However, none of SNPs achieved the genome-wide significance threshold (P < 5 × 10−8). Importantly, three common SNPs (SSC7:7987268, SSC13:42350250, and SSC13:42551718) were associated with both FCR and RFI. Additionally, the NEDD9 gene related to FCR and RFI traits was overlapped. This study detected novel SNPs on SSC7 and SSC13 common for FCR and RFI. These results provide new insights into the genetic mechanisms and candidate genes of FE-related traits in pigs.

L’alimentation des animaux représente une proportion importante du coût d’élevage chez les porcs, et l’efficacité alimentaire (FE) chez les porcs est de toute première importance sur le plan économique. Ainsi, les objectifs de ce travail étaient d’identifier des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) et des gènes candidats associés à des caractères liés à la FE, dont l’indice de conversion alimentaire (FCR pour « feed conversion ratio ») et l’ingestion alimentaire résiduelle (RFI pour « residual feed intake »). Une analyse d’association pangénomique (GWAS) a été réalisée pour le FCR et le RFI chez 169 porcs Yorkshire à l’aide de données de séquençage génomique complet. Au total, 23 et 33 SNP significatifs suggestifs (P < 1 × 10−6) ont été détectés pour le FCR et le RFI, respectivement. Cependant, aucun des SNP n’a atteint le seuil de signification pangénomique (P < 5 × 10−8). Il est important de noter que trois SNP étaient associés en commun avec les deux caractères (SSC7:7987268, SSC13:42350250 et SSC13:42551718). De plus, le gène NEDD9, connu pour être associé à ces deux caractères, logeait dans un intervalle significatif. Cette étude a permis d’identifier de nouveaux SNP sur les chromosomes SSC7 et SSC13 qui sont simultanément associés au FCR et au RFI. Ces résultats apportent un nouvel éclairage sur les mécanismes génétiques et les gènes candidats associés à des caractères contribuant à l’efficacité alimentaire chez les porcs. [Traduit par la Rédaction]