aService d’Hygiène, Epidémiologie, Infectiovigilance et Prévention, Hospices Civils de Lyon

bÉquipe Santé Publique, Epidémiologie et Eco-évolution des Maladies Infectieuses (PHE3ID), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Université de Lyon, Inserm, U1111, Université Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR5308, ENS de Lyon

cCenter of Excellence in Respiratory Pathogens (CERP), Hospices Civils de Lyon, Lyon, France

dSouth African Medical Research Council, Vaccines & Infectious Diseases Analytics Research Unit, Faculty of Health Sciences, University of the Witwatersrand, Johannesburg, South Africa

Correspondence to Christelle Elias, Groupement Hospitalier Sud, Unité d’Hygiène, Epidémiologie, Prévention - Bâtiment 3I, Hospices Civils de Lyon, 165 Chemin du Grand Revoyet, 69 495 Pierre Bénite Cedex, France. Tel: +33 4 72 86 12 73; e-mail: [email protected]